関連線でいつも矢印を引くのは面倒で困っています。

そこでUMLプロファイルによって、次の関連線を登録しました。
　<<submit>>
---------------------->

しかし、UMLプロファイルから読み込んで先程の関連線を使用すると
　<<submit>>
-----------------------

のように矢印部分が消えてしまいます。

つまり下記の部分が反映されません。
<UML:TaggedValue tag="direction" value="Source -> Destination"/>
（または<UML:TaggedValue tag="direction" value="3"/>）

EAのヘルプ（XMLによるUMLプロファイルの情報）をみても
４つに分類されているだけで詳細は、よくわかりません。
・タグ（関連線association：○）
・プロパティウィンドウのタグ（関連線association：×）
・制約（関連線association：○）
・メタファイル（関連線association：×）

同じような現象として、新規要素作成時の言語が「C++」となっているのを
「Java」にしたい為にUMLプロファイルに登録しているのですが、
読み込んで使用すると「C++」に戻ってしまいます。
（<UML:TaggedValue tag="gentype" value="Java"/>の部分）

UMLプロファイルに登録すれば、次回の読み込みからは
全てのプロパティを完全に再現してもらいたいのですが、
何か良い方法はあるのでしょうか？

ご指摘の問題自身についてはバグの可能性もありますので
調査させていただきますが、オプション設定で
回避できるかと思います。

まず、メインメニューから「ツール」→「オプション」を
実行してダイアログを表示してください。

最初の向きの件は、「オブジェクト」カテゴリの中の
「関連の既定値をソースからターゲットに」に
チェックを入れると改善するかと思います。

言語の件は、「生成」カテゴリの中の
「コード生成の規定言語」の設定を変更することで
対応できるかと思います。

ぜひお試しください。