5月29日に頂きましたご指摘です。

○ご指摘

SQL Server2000のDDL生成時に、オートナンバーを指定してもidentityが生成されない

○調査結果

頂きました情報を元に調査をしたところ、DDLの生成の設定画面で
「トリガの生成」にチェックを入れれば、identityが生成されることが
わかりました。このチェックを外すと、生成されません。

この挙動が意図されたものかどうかにつきましては
開発元に確認させていただきます。

このバグは月曜日にリリースするビルド791Jにて修正されます。
(修正を確認済み)

ご迷惑をおかけし申し訳ございませんでした。