サポート宛にいただきましたご指摘の要約です。

○ご指摘

ドキュメント生成で、ノートの内容を出力する際に、ノートの内容が空でも
不要な(テンプレートで指定していない)改行が出力されます。

○回答

改行が付加されることは既知の問題ですが、現時点で対応できておりません。
そのほか、箇条書きの場合などについても同様に改行が出力されます。
(内部ではノートの情報をHTML形式で保存しており、その形式から
ドキュメント出力の形式に変換する際に改行が付加されてしまっています。)

申し訳ございませんが、現時点で回避策はございません。
ご迷惑をおかけし申し訳ございません。

この問題は、ビルド1227で修正いたしました。
長らくご迷惑をおかけし申し訳ございませんでした。