サポート宛にいただきましたご指摘の要約です。

○ご指摘

属性のプロパティ画面(ダイアログ)や操作のプロパティ画面を開いた状態で
他のアプリケーションに切り替え、またEnterprise Architectに戻ってくると
そのプロパティ画面からフォーカスが外れた状態になり、画面をアクティブにしないと
入力できません。

他のプロパティ画面などではフォーカスが適切に維持されます。

○回答

ご指摘通りの事象を確認しました。
属性・操作のダイアログは、ダイアログを開いたままの状態で
クラス図内の他の要素を選択し、その要素の属性や操作を継続して
編集できるようになっているため、ご指摘の問題が発生してしまっている
かと思います。
こちらは、開発元に改善可能かどうか、報告いたします。

このご指摘いただいた挙動は、バージョン12.0 ビルド1207で属性や操作のプロパティダイアログを
変更した結果、結果的に解決しました。最新版をご利用下さい。

長らくご迷惑をおかけし申し訳ございませんでした。