サポート宛にいただきましたご指摘の要約です。

○ご指摘
シーケンス図のメッセージの移動先の近傍にノートが配置されていると、
ノートのY軸方向の下にメッセージの線が移動してしまいます。


○回答
ご指摘の現象はEA10.0 で機能追加された、シーケンス図のメッセージのドラッグの動作変更によるものと思われます。

弊社で試したところ、ご要望の移動は、ALTを押しながらドラッグすることで、回避可能です。

別メッセージではなくノートについては、この動作の対象とするべきかは検討の余地があると思いますので、開発元に連絡するようにいたします。

ご迷惑をおかけしますが、改善があるまでは、ALTキーを押しながらのドラッグで回避していただけますようお願いいたします。

この問題は、本日リリースしましたビルド1008にて
修正いたしました。

長らくご迷惑をおかけし申し訳ございませんでした。