サポート宛にいただきましたご質問の要約です。

○ご質問

最新版のライセンスサーバをインストールすると、接続する場合に

Lost connection to the keystore at ssks://(マシン名)
ERROR: Internal error

というエラーが表示されてしまいます。
対処方法はありますか？

○回答

いろいろと情報を頂きましたが、情報から原因が推測できず、
弊社環境で再現させることもできませんでした。

最新版で提供される機能は利用されていないようでしたので
1つ前のバージョン(2.0)のライセンスサーバで試して頂いたところ
問題無く利用できるとのことでした。

新しいバージョンのライセンスサーバで、何らかの条件で発生する
問題と思われます。条件がわかり次第、開発元に連絡します。

この問題についてインストーラ側に修正を行い、問題が発生しないようになりました。
この問題が発生する環境では、お手数をおかけしますが
最新版のインストーラをダウンロードして、お試しください。

ご迷惑をおかけし申し訳ございませんでした。