サポートに寄せられたご指摘の要約です。

○ご指摘

ダイアグラム上で要素を選択し、Ctrl+Shift+Deleteを実行しても、
要素の完全削除ができません。

ダイアグラム上で要素を選択し、Ctrl+Shift+右クリックで表示される
コンテキストメニューには「選択項目をモデルから完全削除」があり、
Ctrl+Shift+Deleteと表示されています。

さらに、このメニューを選択しても無反応です。

また、EAのメインメニューから「ツール」→「カスタマイズ」の
キーボードタブで、別のキーを割り当てても状況は変わりません。
通常動作するCtrl＋Deleteを割り当てると、このキーも効かなくなります。

○回答

ご指摘の件、確認いたしました。

こちらはEAのバグになりますので、開発元に修正を依頼いたします。

モデルからの完全削除は「Ctrl＋Delete」でも実行可能なため、
修正までは、このキーを割り当てずに、このキーを利用して
回避いただければと思います。

こちらは以下の掲示板にもありますように、メインメニューから「要素」→
「ダイレクト編集」→「選択項目をモデルから完全削除」(Ctrl+Shift+DEL)の対象は
属性および操作であり、EAのバグではないことを改めて開発元に確認いたしました。

「選択項目をモデルから完全削除の機能について」
https://www.sparxsystems.jp/forum/modules/xhnewbb/viewtopic.php?topic_id=2890&viewmode=thread

ヘルプ等、説明を改善させていただきます。

現状、要素をモデルから完全削除する場合は、以下のいずれかの操作になります。
1) ダイアグラム上またはプロジェクトブラウザ上で要素を選択して「Ctrl＋DEL」を押下
2) プロジェクトブラウザ上で要素を選択して右クリックし「モデルから完全削除」を実行