EAを「取り敢えずソースからのリバースエンジニアリングに使おう」と評価している者です。
VB.NETのソースからHTMLドキュメントを生成すると下記のようなコメントが

'　システム名　　　：hogehogeシステム
'　プログラムＩＤ　：AAAA01
'　プログラム名　　：ログイン

改行されずにだらだらとつながって出力されます。そういうものなのでしょうか？（とても見にくいのでイヤ）
それと Class の説明コメントは Class名の下に書かないと生成ドキュメントに反映されず、SubやFunctionは逆に上に書かないと反映されないようです。 ←勘違いでした。
どのドキュメントを見ると「こう書くとこういう風にドキュメント生成される」ということが記述されているでしょうか?
ヘルプの「ソースコードのリバースエンジニアリング」を読んでも書いてありません。

HTMLドキュメントの生成時にソースのコメントが改行されずにつながって出力される件に関しまして、
ローカルオプションダイアログの生成にて「読み込み時にコメントの改行を削除」のチェックを外し、各要素のソースコードを再度読み込みすることによりHTMLドキュメントに改行を含めた上で出力されるようになります。

お試しください。
よろしくお願い致します。

mogassさま
ありがとうございます。できました。
ついでにもう1つ教えていただけませんでしょうか。

'　システム名　　　：hogehogeシステム
'　プログラムＩＤ　：AAAA01
'　プログラム名　　：ログイン
' :コメント

最下行の「'」と「:」の間は半角スペースです（上3行は、たまたま文字の前に全角スペースが入っている）。
これをHTMLドキュメントに落とすとこんな風になって、半角スペースが詰まります。
これはHTMLの仕様(?)でどうにもならないものでしょうか？

　システム名　　　：hogehogeシステム
　プログラムＩＤ　：AAAA01
　プログラム名　　：ログイン
:コメント

全角スペース入れるものちょっとためらわれるもので・・
よろしくお願いいたします。

HTMLドキュメントに出力されるコメントは、ソースの読み込み時に各要素のプロパティの「ノート」という項目に格納されます。
コメントに関しては、ソース読み込み時に各行の先頭半角スペースを削除し「ノート」に格納します。つまりご指摘のケースの場合、EAに取り込んだ時点でスペースが削除された状態になります。読み込み時のこの動作は設定等で変更することはできませんので、プロパティの「ノート」を編集して頂くか、全角スペースを使用して頂く（..）、又はコメント各行の先頭に何か文字列を入れる（'/ システム名 : ～）等の方法でご対応頂ければ幸いです。

とはいえ、HTMLで半角スペースを使用した場合やはり表示上詰まってしまいます。HTMLの仕様かブラウザの仕様なのかは私もわかりませんが、この問題を回避するためにはHTMLドキュメントの生成ダイアログにて「ノート内の空白文字を保持」にチェックしていただくことにより、半角スペースを＆ｎｂｓｐ；に置き換えますので空白としてブラウザ上で表示されるようになります。

お試し下さい。
よろしくお願い致します。