パッケージ単位などでプロジェクトをファイル分割して保存できませんか？
分散開発向けの機能として、複製やセキュリティ機能がある事は知っていますが、ファイルを分割管理できればと思いまして。

Enterprise Architectでは、任意のパッケージあるいは全体を指定して、
XMI(OMGで既定されているXMLファイル)で情報を保存することができます。

この方法を利用することで、分割して保存することができます。
ただし、XMIファイルを読み込む場合には、その対象のパッケージの内容はすべて上書きされますので、
同じパッケージを対象に分散開発する場合には利用できません。
(このような場合には、複製機能をご利用ください)

具体的には、プロジェクトブラウザから対象のパッケージを
指定して、コンテキストメニューから「読み込み/出力」以下の
関連する項目を指定してください。


なお、このXMIでの分割での作業を行う場合には
どうパッケージを分割するか、注意しなければならない場合がございます。

例えば、

親パッケージ
・子パッケージA
・子パッケージB

という階層構造がプロジェクトブラウザにある場合、子パッケージAの要素(クラスなど)を
子パッケージB内のダイアグラムで利用することは可能ですが、そのクラスの情報は
子パッケージAに含まれます。つまり、子パッケージAと子パッケージBをそれぞれ分割した場合には
その子パッケージ内に含まれない要素は編集することができません。
(上の例であれば、もし子パッケージBのみを読み込むと子パッケージAの要素は表示されません。)

つまり、XMIによる分散開発の場合には、それぞれ依存しないような範囲でパッケージを分割するか、あるいは
クラスは別の共有パッケージに格納し、その共有パッケージ(こちらは読み込み専用とする)と
作業用のパッケージで作業をする(作業後にマスタープロジェクトファイルに読み込む)、といったことが
必要となります。