○ご指摘

「既定のソースコード」欄に%の文字を利用すると、保存後に
再度開き直したときに内容が変わってしまいます。

例えば、

int a = 10;
printf("value = %d", a);
return;

と入力して保存すると

int a = 10;
printf("value = 236758344", a);

のようになってしまいます。

○回答

ご指摘の問題を確認しました。
Enterprise Architectのバグになります。ご迷惑をおかけし申し訳ございません。

この問題は次のビルド846で修正されます。
引き続きご迷惑をおかけし申し訳ございません。

(もし、上記問題が致命的であるお客様の場合には
サポートにご相談ください。)

この問題は、ビルド846Jで修正されました。
長らくご迷惑をおかけし申し訳ございませんでした。