○ご指摘

シーケンス図について、メニューから画像の保存をしたり、
シーケンス図全体をコピーしてクリップボード貼り付けによって
画像を作成した場合に標記のように画像に無駄な余白ができます。

このような現象が起こらないシーケンス図もありますが、
原因は、シーケンスの中に自己メッセージが有るか無いかで変わるようです。
（有ると上記現象が発生します。）

○回答

ご指摘の現象を確認できました。

ご報告いただきましたように、自己メッセージがあるシーケンス図の場合に、
問題が発生しているようです。

こちらは、Enterprise Architectのバグになりますので、
開発元に連絡し、修正を依頼いたします。

この問題は、ビルド846Jで修正されました。
長らくご迷惑をおかけし申し訳ございませんでした。