モデル上に凡例を書いても内容が保存されないようです。
保存して閉じた後、再度開くと「凡例」とだけ書いた枠だけが残っています。
バグでしょうか？

ご迷惑をおかけし申し訳ございません。

ご指摘の件ですが、Enterprise Architectが利用している
JETデータベースのバグが原因で発生している可能性が
あります。

メインメニューから「ツール」→「オプション」を実行し
表示されるダイアログの右上の方に「JET4.0を利用(再起動が必要)」
という項目があります。この項目にチェックを入れ、
Enterprise Architectを再起動して下さい。

この問題が原因の場合には、再起動して再表示すると
以前入力した内容も正しく表示されるようになります。
(再入力の必要はありません)

お手数をおかけし申し訳ございませんが、この問題と同じかどうか
ご確認のほどよろしくお願いします。

上記の方法で解決したようです。
ありがとうございました。

ご確認ありがとうございました。
お手数をおかけし申し訳ございませんでした。

このほか、JET3.5にはバグが少なからずあり
UNICODE対応もしていないので、次のバージョン7.5で
JET4.0を既定値・標準とすることも検討しています。