シーケンス番号を表示させると、
1.0や2.17など、接頭に「数値.」が自動的に表示されますが
それを非表示にすることは可能でしょうか？？

現在、「数値.」部分を非表示にする機能はございません。
この表記は、コミュニケーション図でのメッセージ番号と同じ形式を
とっており、編集することが出来ません。

ご希望にお応えすることができず申し訳ございません。

なお、苦肉の案ではありますが、シーケンス図のメッセージプロパティ
のノートに1,2,3,,,と手動で入力し、ダイアログのプロパティで
「メッセージのノートを表示」を有効・ローカルオプションで
シーケンス図のシーケンス番号を非表示にすると、ダイアグラムの
左端に1,2,3,,,と「数値.」のないシーケンシャルな数値を表示する
ことは可能です。