ブレークポイントの設定に失敗します対処方法を教えてください。

以下の環境でビルドしたソースを読み込み、ブレークポイントを設定してデバック実行しても、ブレークポイントの設定に失敗すします。
対象方法を教えてください。

言語：C++、C言語
環境：Microsoft.Net 2003 (.Net framework 1.1)
上記環境でDebugビルドし、デバック実行できることを確認済み

手順：
1.以下の設定で、上記のソースコードのルートディレクトリを指定して、ソースディレクトリの読み込みを実行
　ソースディレクトリを再起的に処理
　各パッケージのクラス図を作成

　名前空間ごとにパッケージを作成

　どちらに設定した場合も失敗
　　同期　既存のクラスを同期
　　　　　既存のクラスを上書き

　どちらに設定した場合も失敗
　　クラスの処理 削除しない
　　 常に削除

2.読み込み中（解析中）に、不明なシンボルの解析中エラーが発生。解析は継続し、読み込み完了のメッセージが表示された。

3.ビルドスクリプト設定
デバックで、上記環境で作成した実行形式ファイルを指定
Enterprise Archtectからのデバック実行で、アプリケーションが実行されることを確認。

4.読み込んだクラスのソースコードを表示し、ブレークポイントを設定

5.デバック実行

6.ブレークポイントの中に？マークが表示される

7.デバック終了
　以下のメッセージが表示される
　「すべてのブレークポイントの設定に失敗しました、デバック版かどうか、モデルとコードの同期がされているか確認して下さい。」

質問：
・ソース読み込み時に不明なシンボルの解析エラーが発生していることが原因でしょうか？
.Netでは、ビルドできているので、プログラム言語のマクロの設定に、.Netと同じデバックオプションを追加しましたが、シンボルエラーはとれませんでした。

・モデルとコードの同期がとれていることの確認手段と、同期をとる方法を教えてください。

以上よろしくお願い致します。