Re: プロジェクトルートとビュー(パッケージ)の使い分け

プロジェクトルートの意味合いとしては、UMLモデル全体を示しています。

そのため、同じ設計の情報であれば、1つのプロジェクトルート配下に
モデルの情報を置くことを想定しています。

なお、プロジェクトルートを横断した情報の共有（要素の参照）は
可能です。

相違点はいくつかありますが、プロジェクトルート以下には直接、
要素やパッケージを置くことができず、ビューと呼ばれるパッケージを
配置するようになっています。
また、パッケージで実行可能な機能（右クリックして表示されるメニュー）と、
プロジェクトルートで実行できるメニューには相違があります。
パッケージのほうがより多くの機能を実行できます。

上記のような意味合いや相違点がありますので、
それぞれ使い分けていただければと思います。

ご不明点がございましたら、ご連絡下さい。