サポート宛てにいただきましたご指摘の要約です。

○ご指摘

DiagramObject.BackgroundColorで要素の背景色を変更していますが
EAビルド1560と1605で値の指定方法が以下のように変わっているようです。

1560: #BBGGRR
1605: #RRGGBB


○回答

弊社環境でも現象が再現いたしました。
開発元に報告いたします。
ご不便をお掛けし申し訳ございません。

回避策につきましては
現時点ではご推察の指定方法以外に
弊社からお伝えできる情報はございません。

この問題は、バージョン16.1 ビルド1621で修正されました。
長らくご迷惑をおかけし申し訳ございませんでした。